苏云金杆菌杀虫蛋白Vp3A的结构

苏云金杆菌杀虫蛋白Vp3A的结构

    Vip3A是一类新型的蛋白质，测序可知Vip3A分子量为88.SkDa，有789个氨基酸残基，对己知蛋自一级结构分析表明，它在遗传上比较保守。在以前的报道中，该类蛋白间的同源性皆高于98%，甚至有100%的同源性，如Vip-C9与Vip3V基因同源性达100随着新基因的克隆及发布，最近的资料表明此类蛋白间的同源性在98.6%-100%之间，说明该类蛋白是一类遗传上比较保守的蛋白。vip3A(a)基因是第一个被克隆的该类基因，Vip3A(a)蛋白的等电点为4.5 ,毒蛋白在pH 5-10之都可溶解。而Vip3A ( c)含有746个氨基酸，比Vip3A ( a)少了C一端43个氨基酸，该蛋白与已知晶体蛋白没有同源性。它的N端含有带正电荷氨基酸( Asn2-Lys7)及其相连的疏水核心功能区( LeuB-Met34 )，这与其它芽抱杆菌的信号肤序列类似。通过SignalP程序分析表明[z']:  Vip3A (a)与己知多数的分泌蛋白不同，其N端虽然存在信号序列，但缺少信号肤酶作用位点。因此，Vip3A ( a)在异位时不存在从N端加工的过程，这种情况在G+细菌中是较少见的。蔡启良等运用生物信息技术，对营养期杀虫蛋白多肤进行了功能结构域比对分析，发现这789多肤蛋白的N端第31至150位残基之间存在一种趋化信号传导因子(CST)相似序列，C端536至666残基之间则存在着纤维素结合结构域(CBD)相似肽。